Magneettitutkimukseen tultaessa varmistetaan, ettei potilaalla ole esteitä tutkimukselle. Tämän jälkeen potilas pääsee pukukoppiin. Mikäli vaatteissa ei ole metallia, potilas voi mennä omissa vaatteissa kuvaukseen. Hoitaja saattaa potilaan kuvaushuoneeseen. Kuvauskohteesta riippuu, mennäänkö magneettikuvauslaitteeseen pää vai jalat edellä. Tämän jälkeen potilas on tutkimushuoneessa noin 10–20 minuuttia. Hoitaja tulee lopuksi hakemaan potilaan ja saattaa tämän pukukoppiin.